根據(jù)國家稅務(wù)總局公告2012年第20號文第一條的規(guī)定，可以選擇簡易辦法按照生物制品銷售額和3%的征收率計(jì)算繳納增值稅的是指取得（食品）藥品監(jiān)督管理部門頒發(fā)的《藥品經(jīng)營許可證》，獲準(zhǔn)從事生物制品經(jīng)營的藥品批發(fā)企業(yè)和藥品零售企業(yè)。

　　A公司在沒有取得《藥品經(jīng)營許可證》的情況下，不屬于經(jīng)獲準(zhǔn)從事生物制品經(jīng)營的藥品批發(fā)企業(yè)和藥品零售企業(yè)，不能按照3%的征收率繳納增值稅。因此，A公司不能按照簡易計(jì)稅適用3%增值稅征收率向醫(yī)院C開票。

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　　相關(guān)規(guī)定：

　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于藥品經(jīng)營企業(yè)銷售生物制品有關(guān)增值稅問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第20號）

　　一、屬于增值稅一般納稅人的藥品經(jīng)營企業(yè)銷售生物制品，可以選擇簡易辦法按照生物制品銷售額和3%的征收率計(jì)算繳納增值稅。

　　藥品經(jīng)營企業(yè)，是指取得（食品）藥品監(jiān)督管理部門頒發(fā)的《藥品經(jīng)營許可證》，獲準(zhǔn)從事生物制品經(jīng)營的藥品批發(fā)企業(yè)和藥品零售企業(yè)。

　　二、屬于增值稅一般納稅人的藥品經(jīng)營企業(yè)銷售生物制品，選擇簡易辦法計(jì)算繳納增值稅的，36個(gè)月內(nèi)不得變更計(jì)稅方法。