（一）研發(fā)項目前期財務(wù)規(guī)劃不及時，管理不完善

高新技術(shù)企業(yè)研發(fā)項目主要分為財政撥付資金科研項目、自主研發(fā)項目及委外研發(fā)項目，研發(fā)項目形式不同，其資金來源也有所不同。中小高新技術(shù)企業(yè)大多存在資源供應(yīng)不足、業(yè)務(wù)單一、市場競爭力低等，研發(fā)項目前期缺少財務(wù)規(guī)劃，以致研發(fā)項目難以有效推進，影響企業(yè)經(jīng)濟效益。高新技術(shù)企業(yè)運行的研發(fā)項目大多分成多個小項目進行，在操作實踐中，中小高新技術(shù)企業(yè)往往未對多個小項目從項目立項、項目預(yù)算進行逐一明確。

（二）研究與開發(fā)環(huán)節(jié)的界定標(biāo)準(zhǔn)模糊，導(dǎo)致研發(fā)費用資本化較難

新企業(yè)會計準(zhǔn)則規(guī)定，企業(yè)在會計核算時應(yīng)對項目所處的研究環(huán)節(jié)或開發(fā)環(huán)節(jié)進行區(qū)分，若無法合理區(qū)分，則應(yīng)將所發(fā)生的研發(fā)支出全部費用化。研發(fā)環(huán)節(jié)的工作往往有交叉，通常是研究中附帶著研發(fā)，研發(fā)的進程又帶有研究，所以區(qū)分十分困難。由于新企業(yè)會計準(zhǔn)則規(guī)定的研究、開發(fā)環(huán)節(jié)的界定標(biāo)準(zhǔn)模糊，對研發(fā)支出資本化條件非常嚴(yán)格，而高新技術(shù)企業(yè)財務(wù)人員受專業(yè)和技能限制，往往無法準(zhǔn)確區(qū)分兩個環(huán)節(jié)的支出，為了簡化核算，財務(wù)人員通常將這兩個環(huán)節(jié)不加區(qū)分，直接將研發(fā)支出費用化。

（三）同時研發(fā)多個項目時無法準(zhǔn)確歸集單個研發(fā)項目支出

在對研發(fā)費用的財務(wù)核算中，往往多個研發(fā)項目同時進行，有時將生產(chǎn)費用、研發(fā)費用、管理費用混為一體，無法確歸集研發(fā)費用。而高新技術(shù)企業(yè)要求按研發(fā)項目歸集研發(fā)費用，在實際操作中，大部分企業(yè)財務(wù)人員因沒有與研發(fā)部門深入溝通，無法確認(rèn)具體的研發(fā)支出，只能通過東拼西湊的方式“湊”出研發(fā)費用。由于多項研發(fā)工作可能形成同種研發(fā)成果;失敗的研發(fā)項目也會形成部分階段性成果，并對其他項目產(chǎn)生影響;實際研發(fā)過程中，多項研發(fā)工作可能同時開展、同一研發(fā)人員可能同時從事多個研發(fā)項目、多個研發(fā)項目同時使用一項研發(fā)設(shè)備、一項設(shè)備可能既用于生產(chǎn)也用于研發(fā)等情況，致使高新技術(shù)企業(yè)財務(wù)人員無法準(zhǔn)確歸集相應(yīng)的單個項目的研發(fā)費用，因此各項研發(fā)項目的實際成本也就無法準(zhǔn)確核算，更不可能很好地控制研發(fā)成本。

（四）財務(wù)管理人員組織架構(gòu)簡單，財務(wù)管理工作不被重視

雖然中小高新技術(shù)企業(yè)意識到人才在企業(yè)生存與發(fā)展中的重要性，實踐中也重視人才的選拔和培養(yǎng)，但在具體的利潤分配中，往往向研發(fā)部、市場部、采購部傾斜，重生產(chǎn)、研發(fā)，輕財務(wù)，對財務(wù)人員的聘用和培養(yǎng)方面投入不足，財務(wù)人員待遇低下，漠視財務(wù)管理的重要性。實踐中，大部分中小高新技術(shù)企業(yè)重生產(chǎn)、研發(fā)，輕財務(wù)管理，財務(wù)人員配備簡單。很多企業(yè)認(rèn)為財務(wù)的職能就是記記賬、報報稅，無法產(chǎn)生效益，所以不重視財務(wù)人員的配備。企業(yè)的財務(wù)人員往往沒有專業(yè)能力來按照會計制度的規(guī)定對研發(fā)費用進行歸集，沒有按研發(fā)項目進行分別核算。很多產(chǎn)值3000萬元以下的企業(yè)，僅配置一名出納及一名兼職會計，財務(wù)管理方面的投入甚少。

（五）財務(wù)管理方面欠缺激勵措施，財務(wù)人員專業(yè)素質(zhì)低、穩(wěn)定性差