一、個人綜合所得應(yīng)納稅額的計算。個人所得稅的征稅方式有三種，即一是按年計征，比如經(jīng)營所得和個人綜合所得是按年計征個稅；二是按月計征；三是按次征收。個人綜合所得個人所得稅的征收方式是按年計征，即按月預(yù)繳個人所得稅，年終匯算清繳，多退少補。

個人所得稅綜合所得應(yīng)納稅額的計算，主要分為兩個步驟，首先計算綜合收入，即工資、薪金所得全額計入收入總額；勞務(wù)報酬、特許權(quán)使用費所得的收入額為實際取得勞務(wù)報酬和特許權(quán)使用費收入的80%；稿酬所得的收入額在扣除20%費用的基礎(chǔ)上，再減按70%計算，即稿酬所得的收入額為實際取得稿酬收入方56%。

然后再計算綜合所得應(yīng)納稅所得額，即個人綜合所得，以每一納稅年度的收入額減除費用60000元，以及專項扣除、專項附加扣除和其他扣除的余額為應(yīng)納稅所得額。

綜合所得應(yīng)納稅額的計算公式為，應(yīng)納稅額=（全年收入總額-60000元-社保和公積金費用-專項附加扣除-其他扣除）*適用稅率-速算扣除數(shù)。

二、年終匯算清繳的相關(guān)規(guī)定。

個人綜合所得需要在年終辦理匯算清繳的納稅申報。按照稅法規(guī)定，個人取得綜合所得且符合下列情形之一的，需要辦理個人所得稅匯算清繳：一是從兩處以上取得綜合所得，而且綜合所得年收入額減除專項扣除后的余額超過60000元。二是取得勞務(wù)報酬所得、稿酬所得、特許權(quán)使用費所得中一項或者多項所得，且年綜合所得年收入額減除專項扣除的余額超過60000元。三是納稅年度內(nèi)預(yù)繳稅額低于應(yīng)納稅額。四是納稅人申請退稅。

1、個人綜合所得年終匯算清繳的時限。需要辦理綜合所得匯算清繳的個人，應(yīng)當(dāng)在取得所得的次年3月1日至6月30日內(nèi)，向任職、受聘單位所在地主管稅務(wù)機關(guān)辦理納稅申報，并報送《個人所得稅年度執(zhí)行納稅申報表》。個人有兩處以上任職、受聘單位的，選擇向其中一處任職、受聘單位所在地主管稅務(wù)機關(guān)辦理納稅申報；個人沒有任職、受聘單位的，向戶籍所在地或經(jīng)常居住地主管稅務(wù)機關(guān)辦理納稅申報。

2、綜合所得匯算清繳需要留存?zhèn)洳楹蛨笏偷馁Y料。個人辦理綜合所得匯算清繳，需要準(zhǔn)備與收入、專項扣除、專項附加扣除和其他扣除、捐贈、享受稅收優(yōu)惠等相關(guān)的資料，并按規(guī)定留存?zhèn)洳榛驁笏汀?/p>

3、個人綜合所得匯算清繳的退稅規(guī)定。個人辦理匯算清繳退稅或者扣繳義務(wù)人為納稅人辦理匯算清繳退稅的，稅務(wù)機關(guān)審核后，按照國庫管理機關(guān)的有關(guān)規(guī)定辦理退稅，個人在申請退稅時提供的匯算清繳信息錯誤時，稅務(wù)機關(guān)應(yīng)告知個人進(jìn)行更；更后，稅務(wù)機關(guān)應(yīng)及時辦理退稅。個人申請退稅時，需要提供在中國境內(nèi)開設(shè)的銀行賬戶，并在匯算清繳地就地辦理退稅。

需要說明的是，個人在辦理個人所得稅綜合所得年度匯算清繳時，其個人取得的綜合所得，年度綜合所得收入不超過12萬元，而且需要辦理匯算清繳補稅的，或者年度匯算清繳補稅金額不超過400元的，個人可以免于辦理個人所得稅綜合所得匯算清繳。