一、增值稅方面，債券屬于金融商品范疇，根據(jù)《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2016〕36號)附件1所附《銷售服務、無形資產(chǎn)、不動產(chǎn)注釋》規(guī)定，“金融商品持有期間(含到期)利息(保本收益、報酬、資金占用費、補償金等)收入”屬于“金融服務”中的“貸款服務”。因此，納稅人持有債券這一金融商品取得的利息收入，屬于增值稅征稅范圍。在征稅范圍內，政策規(guī)定明確免征的，可享受免稅待遇;未明確規(guī)定免征的，則應繳納增值稅。那么，免稅范圍究竟有哪些?36號文件附件3規(guī)定，國債和地方政府債利息收入免征增值稅。隨后，《財政部 國家稅務總局關于進一步明確全面推開營改增試點金融業(yè)有關政策的通知》(財稅〔2016〕46號)和《財政部 國家稅務總局關于金融機構同業(yè)往來等增值稅政策的補充通知》(財稅〔2016〕70號)先后發(fā)布，分別明確規(guī)定：持有政策性金融債券和非政策性金融債券取得的利息收入，屬于36號文件附件3所稱的“金融同業(yè)往來利息收入”，免征增值稅。

需要關注的是，國債和地方政府債利息收入免稅是針對所有納稅人的，任何單位和個人持有國債和地方政府債取得的利息收入，均免征增值稅;金融債券利息收入是作為“金融同業(yè)往來利息收入”免稅的，只有特定“金融機構”持有金融債券取得的利息收入，方可做免稅處理。特定的“金融機構”具體是指36號文件附件3第一條第(二十三)項所規(guī)定的范圍，具體包括銀行、信用合作社、證券公司、金融租賃公司、證券基金管理公司、財務公司、信托投資公司、證券投資基金、保險公司，以及其他經(jīng)人民銀行、銀監(jiān)會、證監(jiān)會、保監(jiān)會批準成立且經(jīng)營金融保險業(yè)務的機構等。上述范圍以外的機構，因不屬于36號文件規(guī)定的“金融機構”，其持有金融債券取得的利息收入不屬于“金融同業(yè)往來利息收入”，無法享受免稅待遇。

除了國債、地方政府債和金融債券有免稅優(yōu)惠政策外，對納稅人持有的鐵路債券以及各類企業(yè)債券的利息收入，無論是金融機構持有還是非金融機構持有，一律征收增值稅。

需要說明的是：企業(yè)購入國債、地方政府債、金融債券的利息收入免征增值稅是指持有至到期取得的利息收入，對持有未到期之前轉讓國債、地方政府債、金融債券和企業(yè)債券，其轉讓收入則不享受稅收優(yōu)惠。財稅〔2016〕36號附件1的銷售服務、無形資產(chǎn)、不動產(chǎn)注釋規(guī)定，屬于金融商品轉讓，應按照賣出價扣除買入價后的余額為銷售額，按金融服務繳納增值稅：金融商品轉讓可以多種產(chǎn)品合并計算，以最后的收益負來確認是否繳納增值稅;不同金融商品轉讓的收益和虧損只能在一個年度內互抵，不得跨年抵減;金融商品轉讓，不得開具增值稅專用發(fā)票，應全額開具增值稅普通發(fā)票。個人金融商品轉讓免征增值稅。

二、企業(yè)所得稅方面，根據(jù)企業(yè)所得稅法規(guī)定，國債利息收入為企業(yè)所得稅免稅收入?！秶叶悇湛偩株P于企業(yè)國債投資業(yè)務企業(yè)所得稅處理問題的公告》(國家稅務總局公告2011年第36號)所稱國債利息收入，是指企業(yè)持有國務院財政部門發(fā)行的國債取得的利息收入。具體按以下規(guī)定執(zhí)行：(1)企業(yè)從發(fā)行者直接投資購買的國債持有至到期，其從發(fā)行者取得的國債利息收入，全額免征企業(yè)所得稅。(2)企業(yè)到期前轉讓國債、或者從非發(fā)行者投資購買的國債，按規(guī)定計算的國債利息收入，免征企業(yè)所得稅。即：國債利息收入=國債金額×(適用年利率÷365)×持有天數(shù)。上述公式中的“國債金額”，按國債發(fā)行面值或發(fā)行價格確定;“適用年利率”按國債票面年利率或折合年收益率確定;如企業(yè)不同時間多次購買同一品種國債的，“持有天數(shù)”可按平均持有天數(shù)計算確定。也就是說，企業(yè)投資者國債持有期間應計利息收入享受免稅待遇，消除了企業(yè)投資者國債持有期間轉讓國債而取得的收入中，未到期兌付應計利息收入是否可視為免稅收入的爭議。

對于地方政府債券，根據(jù)《國家稅務總局關于地方政府債券利息免征所得稅問題的通知》(財稅〔2013〕5號)的規(guī)定，對企業(yè)取得的2012年及以后年度發(fā)行的地方政府債券利息收入，免征企業(yè)所得稅。2011年時，財政部、國家稅務總局就曾下發(fā)通知，明確對企業(yè)取得的2009年、2010年和2011年發(fā)行的地方政府債券利息所得，免征企業(yè)所得稅。這一次則將免稅的范圍擴大至2012年以及以后年度發(fā)行的地方政府債券。但企業(yè)到期前轉讓地方政府債券、或者從非發(fā)行者投資購買的地方政府債券是否可以參照國債，將應計利息收入作為免稅收入呢?法無明確規(guī)定，因此，對二級市場轉讓地方政府債券屬于財產(chǎn)轉讓所得或損失，應當并入企業(yè)所得稅應納稅所得額。

企業(yè)持有鐵路建設債券利息收入。根據(jù)《財政部 國家稅務總局關于鐵路建設債券利息收入企業(yè)所得稅政策的通知》(財稅〔2011〕99號)規(guī)定：對企業(yè)持有2011-2013年發(fā)行的中國鐵路建設債券取得的利息收入，減半征收企業(yè)所得稅。中國鐵路建設債券是指經(jīng)國家發(fā)展改革委核準，以鐵道部為發(fā)行和償還主體的債券。根據(jù)《財政部 國家稅務總局關于20142015年鐵路建設債券利息收入企業(yè)所得稅政策的通知》(財稅〔2014〕2號)規(guī)定：對企業(yè)持有2014和2015年發(fā)行的中國鐵路建設債券取得的利息收入，減半征收企業(yè)所得稅。中國鐵路建設債券是指經(jīng)國家發(fā)展改革委核準，以中國鐵路總公司為發(fā)行和償還主體的債券。根據(jù)《財政部 國家稅務總局關于鐵路債券利息收入所得稅政策問題的通知》(財稅〔2016〕30號)規(guī)定：對企業(yè)投資者持有2016-2018年發(fā)行的鐵路債券取得的利息收入，減半征收企業(yè)所得稅。鐵路債券是指以中國鐵路總公司為發(fā)行和償還主體的債券，包括中國鐵路建設債券、中期票據(jù)、短期融資券等債務融資工具。

對企業(yè)投資國債、地方政府債券鐵路債券以外的債券投資收益，均按規(guī)定計入企業(yè)所得稅收入。

三、個人所得稅方面，個人所得稅法第四條規(guī)定，國債利息和國家發(fā)行的金融債券利息免納個人所得稅。其中，國債利息是指個人持有我國財政部發(fā)行的債券而取得的利息所得，即國庫券利息;國家發(fā)行的金融債券利息是指個人持有經(jīng)國務院批準發(fā)行的金融債券而取得的利息所得。另據(jù)財稅〔2013〕5號規(guī)定：對個人取得的2012年及以后年度發(fā)行的地方政府債券利息收入，免征個人所得稅。但對個人買賣國債或地方政府債券所得，應當要按財產(chǎn)轉讓所得計算繳納個人所得稅。對于一些經(jīng)國務院有關部委批準，以企業(yè)債券形式籌集部分建設資金或經(jīng)營性資金，如鐵道部發(fā)行的**建設債券，中國建設銀行和其他金融機構發(fā)行用于自身經(jīng)營的債券以及企業(yè)依照程序發(fā)行的企業(yè)債券，均不屬于免稅債券范疇，因此，對個人投資企業(yè)債券沒有免稅照顧。

四、印花稅方面，政府發(fā)行債券如果征收印花稅，也只能是按“借款合同”稅目征收。根據(jù)《中人民共和國印花稅暫行條例》印花稅稅目稅率表的規(guī)定，借款合同是銀行及其它金融組織和借款人(不包括銀行同業(yè)拆借)所簽訂的借款合同，按借款金額萬分之零點五貼花。但是政府發(fā)行債券時，發(fā)行人與購買債券方實際上并不簽訂借款合同的，因此不屬于印花稅稅目稅率表中列舉的借款合同稅目，因此不需要繳納印花稅。