全額撥款和差額撥款的區(qū)別是：全額撥款是單位全部費用由國家財政提供，財政可以對單位收入進(jìn)行全面的管理和監(jiān)控，而差額撥款財政只負(fù)責(zé)單位的人員費用，其他費用需單位自籌。

　　全額撥款是一種政府財政分配的形式，采用全額撥款形式的單位有利于國家對其收入進(jìn)行全面的管理和監(jiān)控，也使得單位的經(jīng)費得到充分的保障，簡而言之就是在編人員的工資、福利及績效等各項待遇均由財政全額撥款支付。

　　差額撥款是一部分非營利性機(jī)構(gòu)(如醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu))的國家撥款方式，采用差額撥款形式的單位，財政對單位的監(jiān)控較少，單位自由度很高。按照國家有關(guān)規(guī)定，差額撥款單位要根據(jù)經(jīng)費自主程度，實行工資總額包干或其他符合自身特點的管理辦法，促使其逐步減少國家財政撥款，向經(jīng)費自收自支過渡。