1、在經(jīng)營對象與內(nèi)容方面：金融機構(gòu)以貨幣資金之類的特殊商品為主要經(jīng)營對象，而一般經(jīng)濟組織的經(jīng)營對象只涉及商品的生產(chǎn)與流通，而金融機構(gòu)的經(jīng)營內(nèi)容一般以貨幣資金的收付與借貸，以及各種貨幣資金運動有關(guān)的金融活動為主；

2、在經(jīng)營關(guān)系與原則方面：由于經(jīng)營對象與涉及內(nèi)容的差異，在與客戶間的關(guān)系上，一般經(jīng)濟組織只涉及勞務(wù)或商品的買賣，而金融機構(gòu)將貨幣資金投資或借貸的信用關(guān)系作為其主要內(nèi)容，并遵循“安全性、盈利性、流動性”三性原則；

3、在經(jīng)營風(fēng)險與影響上：一般經(jīng)濟組織需要考慮的重點在于生產(chǎn)流通過程中的產(chǎn)銷問題，而金融機構(gòu)面臨的風(fēng)險包含信用風(fēng)險、擠兌風(fēng)險、利率風(fēng)險、匯率風(fēng)險等多種風(fēng)險。

金融機構(gòu)與一般經(jīng)濟組織的共同點

首先，任何經(jīng)濟組織都必須依法經(jīng)營、照章納稅，并且以上兩種經(jīng)濟組織都需要獨立核算，自負盈虧；其次，金融機構(gòu)與一般經(jīng)濟組織同屬經(jīng)濟組織，都依據(jù)特定的經(jīng)濟目的而運作，具備企業(yè)的基本要素；最后，二者都具有一定的可支配資本，并需要向社會提供特定的商品和服務(wù)，如金融工具等。